Der zugehörige Kritische Bericht ist in Band III/2 (EB 9471) enthalten.
Die choralgebundenen Orgelwerke umfassen neben den großen Choralfantasien traditionelle Kompositionsformen wie die Choralvariation und das Choralricercar. Die beiden Kompositionen des „Magnificat primi toni“ gehören zur Gattung der Choraltoccata, in der sich Toccatenabschnitte und Fugen abwechseln. Zur späten Abteilung im Werk Buxtehudes gehören die Choralvorspiele mit den expressiven Figurationen in der Oberstimme und den fugierten Zwischenspielen.
Die choralgebundenen Orgelwerke sind wieder in zwei Bände aufgeteilt, um eine handliche Größe zu erreichen. Es handelt sich um eine Quellenedition, in der der Notentext für die praktische Nutzung aufbereitet ist, so wurde beispielsweise großer Wert auf die gute Lesbarkeit durch eine flexible Stimmverteilung auf 2 bzw. 3 Systemen und gute Wendestellen gelegt. Der umfangreiche Textapparat (im Band III/2) enthält neben dem Kritischen Bericht ausführliche Informationen zur Notation, zum Ornamentstil und den Orgeln an den Wirkungsstätten Buxtehudes in Dänemark, Schweden und Lübeck.
01. Gelobet seist du, Jesu Christ (BuxWV 188)
02. Nun freut euch, lieben Christen gmein (BuxWV 210)
03. Te Deum laudamus (BuxWV 218)
04. Ach Gott und Herr (BuxWV 177)
05. Ach Herr, mich armen Sünder (BuxWV 178)
06. Christ, unser Herr, zum Jordan kam (BuxWV 180)
07. Danket dem Herren (BuxWV 181)
08. Der Tag, der ist so freudenreich (BuxWV 182)
09. Durch Adams Fall ist ganz verderbt (BuxWV 183)
10. Ein feste Burg ist unser Gott (BuxWV 184)
11. Erhalt uns, Herr, bei deinem Wort (BuxWV 185)
12. Es ist das Heil uns kommen her (BuxWV 186)
13. Es spricht der Unweisen Mund wohl (BuxWV 187)
14. Gelobet seist du, Jesu Christ (BuxWV 189)
15. Gott der Vater wohn uns bei (BuxWV 190)
16. Herr Christ, der einig Gottes Sohn (BuxWV 191)
17. Herr Christ, der einig Gottes Sohn (BuxWV 192)
18. Herr Jesu Christ, ich weiß gar wohl (BuxWV 193)
19. Ich dank dir, lieber Herre (BuxWV 194)
20. Ich dank dir schon durch deinen Sohn (BuxWV 195)
21. Ich ruf zu dir, Herr Jesu Christ (BuxWV 196)
22. In dulci jubilo (BuxWV 197)
23. Jesus Christus, unser Heiland, der den Tod (BuxWV 198)
24. Komm, Heiliger Geist, Herre Gott (BuxWV 199)
25. Komm, Heiliger Geist, Herre Gott (BuxWV 200)
26. Kommt her zu mir, spricht Gottes Sohn (BuxWV 201)
27. Lobt Gott, ihr Christen allzugleich (BuxWV 202)
