Enthält den Kritischen Bericht der Teilbände III/1 und III/2.
Die choralgebundenen Orgelwerke umfassen neben den großen Choralfantasien traditionelle Kompositionsformen wie die Choralvariation und das Choralricercar. Die beiden Kompositionen des „Magnificat primi toni“ gehören zur Gattung der Choraltoccata, in der sich Toccatenabschnitte und Fugen abwechseln. Zur späten Abteilung im Werk Buxtehudes gehören die Choralvorspiele mit den expressiven Figurationen in der Oberstimme und den fugierten Zwischenspielen.
Die choralgebundenen Orgelwerke sind wieder in zwei Bände aufgeteilt, um eine handliche Größe zu erreichen. Es handelt sich um eine Quellenedition, in der der Notentext für die praktische Nutzung aufbereitet ist, so wurde beispielsweise großer Wert auf die gute Lesbarkeit durch eine flexible Stimmverteilung auf 2 bzw. 3 Systemen und gute Wendestellen gelegt. Der umfangreiche Textapparat (im Band III/2) enthält neben dem Kritischen Bericht ausführliche Informationen zur Notation, zum Ornamentstil und den Orgeln an den Wirkungsstätten Buxtehudes in Dänemark, Schweden und Lübeck.
28. Magnificat primi toni (BuxWV 203)
29. Magnificat primi toni (BuxWV 204)
30. Magnificat noni toni (BuxWV 205)
31. Mensch, willt du leben seliglich (BuxWV 206)
32. Mit Fried und Freud ich fahr dahin (BuxWV 76)
33. Nimm von uns, Herr, du treuer Gott (BuxWV 207)
34. Nun bitten wir den Heiligen Geist (BuxWV 208)
35. Nun bitten wir den Heiligen Geist (BuxWV 209)
36. Nun komm, der Heiden Heiland (BuxWV 211)
37. Nun lob, mein Seel, den Herren (BuxWV 212)
38. Nun lob, mein Seel, den Herren (BuxWV 213)
39. Nun lob, mein Seel, den Herren (BuxWV 314)
40. Nun lob, mein Seel, den Herren (BuxWV 215)
41. Puer natus in Bethlehem (BuxWV 217)
42. Vater unser im Himmelreich (BuxWV 219)
43. Von Gott will ich nicht lassen (BuxWV 220)
44. Von Gott will ich nicht lassen (BuxWV 221)
45. Wär Gott nicht mit uns diese Zeit (BuxWV 222)
46. Wie schön leuchtet der Morgenstern (BuxWV 223)
47. Wir danken dir, Herr Jesu Christ (BuxWV 224)
48. Auf meinen lieben Gott (BuxWV 179)
49. O lux beata Trinitas (BuxWV 216)
50. Klag-Lied (BuxWV 76)
51. Nun lob, mein Seel, den Herren (BuxWV 213)
52. Vater unser im Himmelreich (BuxWV 219)
